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公司新聞

細(xì)胞膜熒光探針DIR化學(xué)

 細(xì)胞膜熒光探針DIR化學(xué)性質(zhì)
  熒光定量PCR(細(xì)胞膜熒光探針DIR)所使用的熒光化學(xué)制劑可分為兩種:熒光探針和熒光染料。PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對(duì)引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號(hào)被淬滅基團(tuán)吸收;PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而熒光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)可接收到熒光信號(hào),即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,實(shí)現(xiàn)了熒光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。
  實(shí)時(shí)熒光PCR(細(xì)胞膜熒光探針DIR)技術(shù)靶基因的確定及引物和探針的設(shè)計(jì)原則
  1.靶基因的確定:選擇檢測(cè)組共有的基因以避**測(cè)的假陰性(漏檢)。
  2.檢測(cè)片段的確定:選擇檢測(cè)組內(nèi)的保守 (突變少)(避免假陰性)、組間特異的序列 (突變多)(避免假陽(yáng)性)作為引物探針的設(shè)計(jì)位置。片段長(zhǎng)度70-150bp。
  3.引物:長(zhǎng)度17-25bp;GC含量30-80%;退火溫度(Tm值)58-60℃;避免穩(wěn)定的引物二聚體(特別是多聯(lián)檢測(cè))及發(fā)夾結(jié)構(gòu)(自由能大于-3.5kc/m);序列不能出現(xiàn)連續(xù)的G,3’端避免G或C,*后5個(gè)堿基內(nèi)避免兩個(gè)以上的G或C。
  4.探針:長(zhǎng)度20-30bp(Taqman)或16-25bp(MGB);GC含量30-80%;Tm值為68-70℃;避免穩(wěn)定的二聚體及發(fā)夾結(jié)構(gòu) (自由能大于-3.5kc/m);5’端不能是G;位置盡量靠近上游引物;選擇波長(zhǎng)差異較大(多聯(lián)檢測(cè))或Fam(單聯(lián)檢測(cè))的熒光標(biāo)記。

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