Cy5熒光染料的材質(zhì)熒光又作“螢光”，是一種光致冷發(fā)光現(xiàn)象。當(dāng)某種常溫物質(zhì)經(jīng)某種波長(zhǎng)的入射光（通常是紫外線或X射線）照射，吸收光能后進(jìn)入激發(fā)態(tài)，并且立即退激發(fā)并發(fā)出出射光（通常波長(zhǎng)比入射光的的波長(zhǎng)長(zhǎng)，在可見(jiàn)光波段）；而且一旦停止入射光，發(fā)光現(xiàn)象也隨之立即消失。具有這種性質(zhì)的出射光就被稱(chēng)之為熒光。在日常生活中，人們通常廣義地把各種微弱的光亮都稱(chēng)為熒光，而不去仔細(xì)追究和區(qū)分其發(fā)光原理。
光照射到某些原子時(shí)，光的能量使原子核周?chē)囊恍╇娮佑稍瓉?lái)的軌道躍遷到了能量更高的軌道，即從基態(tài)躍遷到**激發(fā)單線態(tài)或**激發(fā)單線態(tài)等。**激發(fā)單線態(tài)或**激發(fā)單線態(tài)等是不穩(wěn)定的，所以會(huì)恢復(fù)基態(tài)，當(dāng)電子由**激發(fā)單線態(tài)恢復(fù)到基態(tài)時(shí)，能量會(huì)以光的形式釋放，所以產(chǎn)生熒光。
熒光是物質(zhì)吸收光照或者其他電磁輻射后發(fā)出的光。大多數(shù)情況下，發(fā)光波長(zhǎng)比吸收波長(zhǎng)較長(zhǎng)，能量更低。但是，當(dāng)吸收強(qiáng)度較大時(shí)，可能發(fā)生雙光子吸收現(xiàn)象，導(dǎo)致輻射波長(zhǎng)短于吸收波長(zhǎng)的情況發(fā)生。當(dāng)輻射波長(zhǎng)與吸收波長(zhǎng)相等時(shí)，既是共振熒光。常見(jiàn)的例子是物質(zhì)吸收紫外光，發(fā)出可見(jiàn)波段熒光，我們生活中的熒光燈就是這個(gè)原理，涂覆在燈管的熒光粉吸收燈管中汞蒸氣發(fā)射的紫外光，而后由熒光粉發(fā)出可見(jiàn)光，實(shí)現(xiàn)人眼可見(jiàn)。
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