這一期我們講的是,一種有助于確定RNA命運的蛋白質(zhì)。

..................................................................................................................................................
從DNA轉(zhuǎn)錄后,RNA可以進入許多命運。雖然熟悉的途徑可能直接導(dǎo)致蛋白質(zhì)的產(chǎn)生,但RNA分子本身也可以變得能夠改變基因的表達。新研究有助于解釋如何實現(xiàn)RNA序列的命運。
在洛克菲勒大學(xué)8月27日發(fā)表的一項研究中,洛克菲勒大學(xué)的科學(xué)家和哥倫比亞大學(xué)的一位同事發(fā)現(xiàn)了一種蛋白質(zhì),它可以識別RNA序列上的化學(xué)指令標簽,這是決策過程中的重要一步。
“這種標記,稱為m6A,是四十多年前在RNA序列上發(fā)現(xiàn)的。從那以后,這個豐富的標簽已經(jīng)涉及影響蛋白質(zhì)生產(chǎn)的幾個重要過程,以及所謂的microRNAs,“研究作者Sohail Tavazoie,Leon Hess副教授,伊麗莎白和Vincent Meyer實驗室負責人說。系統(tǒng)癌癥生物學(xué)。(Micro-RNAs是一種小RNA分子,不會編碼蛋白質(zhì),反而會降低基因的活性。)
“然而,”Tavazoie說,“一個揮之不去的問題仍然存在:什么在細胞核內(nèi)讀取這種化學(xué)標簽?我實驗室的研究員ClaudioAlarcón發(fā)現(xiàn)了一種這樣的“讀取”蛋白質(zhì)。由于所涉及過程的基本性質(zhì),這一發(fā)現(xiàn)對細胞的正常功能和**都有影響?!?br />
該標簽稱為m6A,是與腺苷的特定部分連接的甲基,腺苷是RNA序列的一個組成部分。在之前的工作中,Alarcón及其同事將m6A標簽鑒定為microRNA生成的重要調(diào)節(jié)因子。已經(jīng)知道放置這種標簽的“作者”蛋白質(zhì)標記需要在它們被翻譯成蛋白質(zhì)之前進行剪接的RNA分子。許多基因含有必須切除的切片,RNA剪接過程對細胞的功能和特性至關(guān)重要。
近期的實驗表明,新發(fā)現(xiàn)的讀取器,一種稱為HNRNPA2B1的蛋白質(zhì),可以識別RNA上的m6A標記,這些標記注定了兩種不同的命運:修剪成為microRNA或剪接以正確生成蛋白質(zhì)。在識別microRNA前體上的m6A標簽后,HNRNPA2B1然后募集切割機器,負責進一步修剪和處理這些RNA分子。未來的工作需要了解HNRNPA2B1如何與參與RNA剪接的蛋白質(zhì)相互作用。
研究人員懷疑HNRNPA2B1蛋白是一種閱讀器,因為他們發(fā)現(xiàn)它經(jīng)常與m6A標簽附著的RNA分子上的相同位點結(jié)合。為了確定所謂的讀者在那里做了什么,該團隊減少了它在細胞中的存在。
在HNRNPA2B1水平降低的細胞中,他們發(fā)現(xiàn)microRNA的整體表達發(fā)生了變化,許多microRNA減少了。他們還研究了用于剪接的RNA的影響。在這里,他們也發(fā)現(xiàn)了不同RNA分子拼接的變化,這些變化依賴于m6A標簽。
HNRNPA2B1是**個被鑒定的m6A核讀取器,來自實驗的證據(jù)表明在細胞核內(nèi)還存在可識別該標簽的額外讀者。
“這種新型m6A閱讀器的發(fā)現(xiàn)對各種各樣的過程產(chǎn)生了影響,”Alarcón說?!癛NA剪接確立了細胞中可用蛋白質(zhì)的所有組成成分。同時,microRNA的異常與包括癌癥在內(nèi)的多種**有關(guān)。這項工作也有助于越來越多的證據(jù)表明超出RNA序列的信息,如化學(xué)修飾,可以決定RNA分子的*終命運和功能。“
圖片:準備閱讀:新識別的蛋白質(zhì)HNRNPA2B1(綠色)識別m6A標簽,位于細胞核(藍色)內(nèi)。肌動蛋白絲是細胞結(jié)構(gòu)的重要元素,呈紅色。圖片來源:Lisa Noble和Gloria Wu
科學(xué)新聞參考:
HNRNPA2B1是m6A依賴性核RNA加工事件的介質(zhì)。ClaudioR.Alarcón,Hani Goodarzi,Hyeseung Lee,Xuhang Liu,Saeed Tavazoie和Sohail F. Tavazoie。Cell,2015。http ://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674 (15)01024-7 。
.........................................................................................................................................................
