本周,百螢生物為大家推薦的是AAT Bioquest研發(fā)的可用于SARS-CoV-2的產(chǎn)品。什么是SARS-CoV-2?什么是COVID-19?它的組成結(jié)構(gòu)是什么?它的病原體檢測方案有哪些?感興趣的小伙伴一起來看看吧!
COVID-19簡介
冠狀病毒病2019(COVID-19)是由嚴(yán)重急性呼吸系統(tǒng)綜合癥冠狀病毒2(SARS-CoV-2)引起的傳染病。它*初于2019年12月在中國武漢被發(fā)現(xiàn),截止現(xiàn)在,COVID-19已感染185個(gè)國家的260萬人,導(dǎo)致超過200,000人死亡(截至2020年4月26日)。雖然大多數(shù)感染的患者會(huì)出現(xiàn)以發(fā)燒,咳嗽和呼吸急促為特征的輕度癥狀,但這種**會(huì)發(fā)展成致命的肺炎和急性呼吸衰竭,對**力逐漸降低的老年人有很大的感染率。
SARS-CoV-2結(jié)構(gòu):RNA和蛋白質(zhì)成分
SARS-CoV-2的結(jié)構(gòu)成分由以下組成:刺突蛋白,膜糖蛋白,包膜蛋白,核衣殼蛋白和RNA。下表概述了每個(gè)組件的功能。
SARS-CoV-2組成 | 功能 |
刺突蛋白 | 刺突蛋白(S蛋白)是大型的,高度糖基化的跨膜蛋白,在病毒表面形成獨(dú)特的冠狀外觀。S蛋白的胞外域由N端和C端域組成,分別稱為S1和S2亞基。含有受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域的S1亞基負(fù)責(zé)識別并與宿主細(xì)胞受體結(jié)合。S2亞基包含一個(gè)融合肽和兩個(gè)七肽重復(fù)序列(HR1和HR2),負(fù)責(zé)病毒細(xì)胞膜融合。從**的角度來看,S蛋白是SARS-CoV-2疫苗和能夠阻止病毒結(jié)合和融合的療法(例如抗體)的抗病毒研發(fā)靶標(biāo)。 |
膜蛋白 | 膜蛋白(M蛋白)是所有結(jié)構(gòu)蛋白中*豐富的,它們定義了病毒包膜的形狀。M蛋白被認(rèn)為是SARS-CoV-2的主要配位體,因?yàn)樗c所有主要的冠狀病毒結(jié)構(gòu)蛋白相互作用。M蛋白與S蛋白的相互作用促進(jìn)了S蛋白在ER-高爾基體中的保留并整合到新的病毒體中。M蛋白和N蛋白相互作用可穩(wěn)定核衣殼并促進(jìn)病毒加載的完成。M蛋白和E蛋白相互作用形成病毒包膜,其有助于病毒樣顆粒的產(chǎn)生和釋放。 |
包膜蛋白 | 包膜蛋白(E蛋白)是結(jié)構(gòu)蛋白中*小的。它們對于病毒的產(chǎn)生和成熟至關(guān)重要,并有助于病毒的釋放。一小部分E蛋白被整合到病毒粒子包膜中,而大多數(shù)則位于細(xì)胞內(nèi)運(yùn)輸?shù)牟课唬ɡ鏓R-高爾基體)。 |
核衣殼蛋白 | 高度磷酸化的核衣殼蛋白(N蛋白)主要功能是結(jié)合SARS-CoV-2 RNA基因組并將其封裝在病毒包膜內(nèi),形成核糖核衣殼復(fù)合物。該衣殼對于病毒自加載和復(fù)制至關(guān)重要。N蛋白也影響宿主細(xì)胞對病毒感染的反應(yīng)。 |
RNA基因組 | RNA是病毒的基因組。一旦SARS-CoV-2進(jìn)入宿主細(xì)胞,它就會(huì)復(fù)制基因組RNA以產(chǎn)生更小的亞基因組RNA片段。這些片段用于合成病毒感染所必需的蛋白質(zhì)(例如S,M,N和E蛋白)。 |
用于病毒研究的研究方案
擁有正確的實(shí)驗(yàn)試劑對于加快COVID-19和SARS-CoV-2的科學(xué)研究至關(guān)重要。從用于病毒表征和疫苗開發(fā)的基因組工具,到用于快速診斷試劑盒開發(fā)的**分析實(shí)驗(yàn),百螢為您提供了**的實(shí)驗(yàn)方案來推動(dòng)您的研究。
通過Sanger測序發(fā)現(xiàn)病毒基因組
表1.用于Sanger測序的MagaDye ddNTP產(chǎn)品。
產(chǎn)品名稱 | 核苷酸 | Ex(nm) | Em(nm) | Abs(nm) | 規(guī)格 | 貨號 |
MagaDye 535-ddGTP | 鳥嘌呤 | 503nm | 536nm | 503nm | 5 nmoles | 17063 |
50 nmoles | 17067 | |||||
MagaDye 561-ddATP | 腺嘌呤 | 498nm | 561nm | 498nm | 5 nmoles | 17062 |
50 nmoles | 17066 | |||||
MagaDye 588-ddTTP | 胸腺嘧啶 | 498nm | 588nm | 498nm | 5 nmoles | 17061 |
50 nmoles | 17065 | |||||
MagaDye 613-ddCTP | 胞嘧啶 | 498nm | 614nm | 498nm | 5 nmoles | 17060 |
50 nmoles | 17064 |
表2.MagaDye 4色 Sanger測序終止試劑盒。
產(chǎn)品名稱 | ddNTPs | Ex(nm) | Em(nm) | Abs(nm) | 規(guī)格 | 貨號 |
MagaDye 4色Sanger測序終止試劑盒 |
ddGTP ddATP ddTTP ddCTP |
488nm |
536 nm 561 nm 588 nm 614 nm |
498nm | 5 nmoles | 17068 |
COVID-19病原體檢測的研究方案
通過RT-PCR進(jìn)行核酸分析和血清檢測是廣泛用于檢測SARS-CoV-2的兩種技術(shù)。RT-PCR是應(yīng)用*廣泛的平臺,建議用于SARS-CoV-2早期感染的篩查或診斷。RT-PCR可以在血清轉(zhuǎn)化之前檢測病毒RNA的存在,血清轉(zhuǎn)化是針對病原體并在血液中可檢測到的特異性抗體的時(shí)間段。如酶聯(lián)**吸附測定(ELISA)和側(cè)向流動(dòng)**測定(LFIA)之類的血清檢測可檢測血清中是否存在對病毒感染產(chǎn)生的抗體。
RNA定量和PCR試劑
產(chǎn)品名稱 | Ex(nm) | Em(nm) | 規(guī)格 | 貨號 |
StrandBrite 綠色熒光RNA定量試劑盒*高選擇性* | 490nm | 540nm | 100 Tests | 17657 |
StrandBrite 綠色RNA定量試劑 | 490nm | 525nm | 1ml | 17610 |
10ml | 17611 | |||
Portelite 熒光RNA定量試劑盒 | 490nm | 525nm | 100 Tests | 17658 |
500 Tests | 17659 | |||
Cyber Green [相當(dāng)于SYBR®Green] * 20X水性PCR溶液* | 498nm | 522nm | 5 x 1 mL Tests | 17591 |
1ml | 17592 | |||
Cyber Green 核酸凝膠染料[相當(dāng)于SYBR®Green] | 498nm | 522nm | 100ul | 17604 |
1ml | 17590 |
疫苗開發(fā)的研究方案
蛋白酶在蛋白質(zhì)激活、細(xì)胞調(diào)節(jié)和細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中以及在氨基酸合成中的蛋白質(zhì)合成或在其他代謝途徑中的利用中起著至關(guān)重要的作用。抑制多蛋白蛋白水解加工所必需的病毒蛋白酶已分別是**人類**缺陷病毒(HIV)和丙型肝炎的成功策略,證明蛋白酶抑制劑可用于**病毒感染。同樣,SARS-CoV-2的主要蛋白酶(M pro或3 CL pro)被認(rèn)為對病毒基因表達(dá)和復(fù)制至關(guān)重要,因此被認(rèn)為是抗CoV**設(shè)計(jì)的主要目標(biāo)。
Covidyte COVID-19肽底物
產(chǎn)品名稱 | 序列長度 | Ex(nm) | Em(nm) | ε1 | 規(guī)格 | 貨號 |
Covidyte EN450 | 14個(gè)氨基酸 | 336nm | 455nm | 5900 | 100 Tests | 13535 |
1000 Tests | 13536 | |||||
Covidyte ED450 | 11個(gè)氨基酸 | 336nm | 455nm | 5900 | 100 Tests | 13537 |
1000 Tests | 13538 | |||||
Covidyte TF670 | 14個(gè)氨基酸 | 649nm | 664nm | 250,000 | 100 Tests | 13540 |
1000 Tests | 13541 | |||||
Covidyte IF670 | 11個(gè)氨基酸 | 656nm | 670nm | 250,000 | 100 Tests | 13542 |
1000 Tests | 13543 |
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